Después del incidente en la iglesia, Saber y Shirou regresan a casa solo para encontrar a Rin en el piso y gravemente herido. Resulta que Kirei Kotomine la atacó, mientras que Shirou y Saber estaban ocupados y eso no es todo porque también se ha llevado a Ilya y planea hacerle el sacrificio por el Santo Grial. Ayudados con el último consejo de Rin, ambos se dirigen a Ryudouji, donde Kirei convocará al Santo Grial. Saber volverá a pelear con Gilgamesh y Shirou tendrá que dejarla y tratar con Kirei, quien obviamente tiene algún tipo de venganza personal contra Shirou. La pelea final acaba de comenzar.